MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Leptospira interrogans serovar Lai str. 56601 chromosome II

Total Repeats: 1736

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004343	TGT	2	6	3438	3443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004343	GTT	2	6	3473	3478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004343	AATT	2	8	3483	3490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004343	AGT	2	6	3530	3535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004343	TTTTG	2	10	3601	3610	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004343	TTCT	2	8	3698	3705	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_004343	TAG	2	6	3802	3807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004343	T	6	6	3867	3872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004343	GAAA	2	8	3875	3882	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004343	AT	3	6	3928	3933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004343	AGTT	2	8	3947	3954	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004343	T	6	6	3963	3968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_004343	GGA	2	6	4024	4029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004343	TTTG	2	8	4056	4063	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004343	T	6	6	4912	4917	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004343	TCT	2	6	4935	4940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_004343	ATT	2	6	4945	4950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004343	T	6	6	4996	5001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004343	TTTAA	2	10	5011	5020	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004343	TA	3	6	5108	5113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004343	TAC	2	6	5138	5143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_004343	A	6	6	5153	5158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004343	GAA	2	6	5198	5203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004343	A	7	7	5202	5208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004343	A	6	6	5242	5247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_004343	AGA	2	6	6115	6120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004343	GCG	2	6	6125	6130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_004343	AAC	2	6	6156	6161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_004343	TCT	3	9	6167	6175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_004343	AAT	2	6	6218	6223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004343	A	8	8	6226	6233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004343	T	6	6	6343	6348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004343	CTT	2	6	6361	6366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_004343	A	7	7	15120	15126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004343	AAG	2	6	15147	15152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004343	GTT	2	6	16181	16186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004343	AATT	2	8	16191	16198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004343	AGT	2	6	16236	16241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004343	CAA	2	6	16269	16274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_004343	TAT	2	6	16278	16283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004343	AGA	2	6	16315	16320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004343	TTTA	2	8	16328	16335	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004343	TTG	2	6	17709	17714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_004343	AG	3	6	17810	17815	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004343	AACC	2	8	17820	17827	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_004343	AAT	2	6	17832	17837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004343	TCG	2	6	17854	17859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_004343	TCT	2	6	17874	17879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_004343	GGT	2	6	17955	17960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004343	GGTT	2	8	18131	18138	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004343	AAG	2	6	18207	18212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004343	CT	3	6	18232	18237	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_004343	GA	3	6	19504	19509	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004343	CTG	2	6	19515	19520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_004343	GTTAA	2	10	19611	19620	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004343	ATC	2	6	19647	19652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_004343	GATTT	2	10	19699	19708	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004343	TTG	2	6	19728	19733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_004343	AATT	2	8	19737	19744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004343	CAA	2	6	19815	19820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_004343	TAT	2	6	19824	19829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_004343	TGTAT	2	10	20136	20145	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004343	T	8	8	20780	20787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004343	TGGAAG	2	12	20823	20834	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004343	GCC	2	6	20901	20906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_004343	AAT	2	6	20998	21003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_004343	ATTGA	2	10	22167	22176	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004343	CCCTA	2	10	22199	22208	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
69	NC_004343	TTTGA	2	10	22255	22264	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_004343	GT	4	8	22267	22274	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004343	TGAA	2	8	22280	22287	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004343	AGAA	2	8	23963	23970	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004343	AAC	2	6	23976	23981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_004343	T	6	6	23996	24001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004343	A	6	6	24639	24644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_004343	TCAA	2	8	24811	24818	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_004343	ATTT	2	8	24825	24832	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004343	TGC	2	6	24875	24880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_004343	ATG	2	6	24903	24908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_004343	TAC	2	6	24918	24923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_004343	GAATA	2	10	24934	24943	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_004343	T	6	6	25019	25024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004343	TAA	2	6	25057	25062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_004343	AGT	2	6	25087	25092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004343	ATAG	2	8	25150	25157	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_004343	TAT	2	6	25163	25168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_004343	T	7	7	26409	26415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004343	CTAAC	2	10	26855	26864	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_004343	TTG	2	6	26926	26931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_004343	AATT	2	8	26935	26942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004343	CAA	2	6	27013	27018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_004343	T	6	6	27050	27055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_004343	TTAT	2	8	27138	27145	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_004343	TAAA	2	8	27187	27194	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_004343	GA	3	6	28542	28547	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_004343	AAT	2	6	30294	30299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_004343	T	6	6	30309	30314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004343	GTC	2	6	30347	30352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_004343	GGT	2	6	30531	30536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_004343	ATTAA	2	10	30558	30567	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_004343	TCT	2	6	30641	30646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_004343	AAAC	2	8	30678	30685	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_004343	A	8	8	30695	30702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_004343	ATT	2	6	31326	31331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_004343	GAATA	2	10	31344	31353	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_004343	T	7	7	33428	33434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_004343	ATTT	2	8	33455	33462	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_004343	T	6	6	33460	33465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_004343	AC	3	6	33511	33516	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_004343	TGT	2	6	33517	33522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_004343	GA	3	6	33537	33542	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_004343	AAAAT	2	10	33608	33617	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_004343	GTA	2	6	33623	33628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_004343	ATG	2	6	33635	33640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_004343	A	6	6	33647	33652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_004343	ACG	2	6	34794	34799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_004343	TGT	3	9	34807	34815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_004343	TGA	2	6	34900	34905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_004343	T	6	6	34911	34916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_004343	GTT	2	6	34961	34966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_004343	TTG	2	6	34999	35004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_004343	AGTC	2	8	35013	35020	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_004343	TTCTCT	2	12	35048	35059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_004343	A	6	6	35125	35130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_004343	T	6	6	35425	35430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_004343	AGT	2	6	35484	35489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_004343	ATT	2	6	35532	35537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_004343	T	7	7	35539	35545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_004343	CAT	2	6	35576	35581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_004343	ATT	2	6	35638	35643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_004343	AATAGT	2	12	35662	35673	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_004343	T	7	7	35792	35798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_004343	T	8	8	35880	35887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_004343	ATTCT	2	10	35956	35965	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_004343	AAT	2	6	36000	36005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_004343	T	7	7	37355	37361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_004343	GTT	2	6	37386	37391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_004343	A	6	6	37478	37483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_004343	AGT	2	6	37562	37567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_004343	GTA	2	6	37635	37640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_004343	CCCAC	2	10	37644	37653	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
142	NC_004343	AAG	2	6	37729	37734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_004343	CT	3	6	37754	37759	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_004343	GA	3	6	39026	39031	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_004343	CTG	2	6	39037	39042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_004343	T	6	6	39053	39058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_004343	AAC	2	6	39249	39254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_004343	GTA	2	6	39391	39396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_004343	ATA	2	6	39413	39418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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